Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd2Q149F1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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