Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms