Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms