Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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