Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MestQ07646 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MestQ07646 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms