Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
AmbpQ07456 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
AmbpQ07456 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms