Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms