Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms