Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1sQ02789 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms