Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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NfiaQ02780 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NfiaQ02780 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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