Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb5Q02739 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms