Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms