Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23aQ01405 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sec23aQ01405 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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