Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2bQ01097 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms