Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms