Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Stx2Q00262 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms