Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gbp10Q000W5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms