Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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