Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NficP70255 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NficP70255 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NficP70255 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NficP70255 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NficP70255 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms