Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxd13P70217 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd13P70217 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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