Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms