Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia3P60469 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms