Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps5P59438 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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