Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdl3P58873 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms