Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms