Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Exosc10P56960 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Exosc10P56960 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Exosc10P56960 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Exosc10P56960 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms