Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf5P56477 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf5P56477 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms