Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms