Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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