Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms