Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gli1P47806 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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