Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms