Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sept1P42209 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms