Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Mmp9P41245 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Mmp9P41245 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Mmp9P41245 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Mmp9P41245 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Mmp9P41245 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mmp9P41245 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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