Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
VhlP40338 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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