Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms