Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxc11P31313 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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