Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lef1P27782 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lef1P27782 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms