Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U2af2P26369 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U2af2P26369 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U2af2P26369 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms