Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChgaP26339 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms