Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nfkb1P25799 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms