Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZfaP23607 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZfaP23607 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms