Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkchP23298 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms