Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PrkcaP20444 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms