Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P20040 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P20040 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
P20040 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P20040 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
P20040 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P20040 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P20040 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P20040 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms