Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfaP20033 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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