Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18524 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18524 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18524 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms