Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtpraP18052 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms