Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb1P12658 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Calb1P12658 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms