Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ApcsP12246 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms